Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm4T1NXB5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms