Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer1Q9Z2Y3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms