Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms