Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Robo3Q9Z2I4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms