Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms