Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip6Q9Z1Y4 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms