Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn9Q9Z0S7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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