Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PapolbQ9WVP6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms