Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Snx1Q9WV80 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Snx1Q9WV80 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Snx1Q9WV80 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Snx1Q9WV80 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Snx1Q9WV80 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx1Q9WV80 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Snx1Q9WV80 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Snx1Q9WV80 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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