Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms