Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Pfdn5Q9WU28 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Pfdn5Q9WU28 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Pfdn5Q9WU28 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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