Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam50bQ9WTJ8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms