Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamc3Q9R0B6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms