Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Gpc6Q9R087 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Gpc6Q9R087 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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Gpc6Q9R087 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Gpc6Q9R087 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Gpc6Q9R087 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Gpc6Q9R087 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Gpc6Q9R087 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Gpc6Q9R087 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Gpc6Q9R087 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Gpc6Q9R087 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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