Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col4a3Q9QZS0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms