Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Trpc3Q9QZC1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Trpc3Q9QZC1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Trpc3Q9QZC1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Trpc3Q9QZC1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Trpc3Q9QZC1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Trpc3Q9QZC1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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