Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms