Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms