Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mid2Q9QUS6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms