Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dkk3Q9QUN9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Dkk3Q9QUN9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dkk3Q9QUN9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dkk3Q9QUN9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dkk3Q9QUN9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms