Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms