Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms