Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms