Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Prg3Q9JL95 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Prg3Q9JL95 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Prg3Q9JL95 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Prg3Q9JL95 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Prg3Q9JL95 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms