Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms