Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms