Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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