Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms