Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms