Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms