Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt112Q9DCG9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms