Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms