Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rnf6Q9DBU5 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rnf6Q9DBU5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rnf6Q9DBU5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rnf6Q9DBU5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rnf6Q9DBU5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rnf6Q9DBU5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms