Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Smg9Q9DB90 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Smg9Q9DB90 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Smg9Q9DB90 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Smg9Q9DB90 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Smg9Q9DB90 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Smg9Q9DB90 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smg9Q9DB90 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Smg9Q9DB90 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Smg9Q9DB90 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Smg9Q9DB90 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Smg9Q9DB90 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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