Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
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