Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pop5Q9DB28 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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