Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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