Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4bQ9D8B3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms