Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Nop56Q9D6Z1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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