Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Clvs1Q9D4C9 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clvs1Q9D4C9 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clvs1Q9D4C9 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clvs1Q9D4C9 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Clvs1Q9D4C9 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clvs1Q9D4C9 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Clvs1Q9D4C9 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clvs1Q9D4C9 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clvs1Q9D4C9 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clvs1Q9D4C9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clvs1Q9D4C9 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clvs1Q9D4C9 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clvs1Q9D4C9 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clvs1Q9D4C9 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clvs1Q9D4C9 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clvs1Q9D4C9 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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