Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms