Protein–RNA interactions for Protein: Q9D350

Obox1, OBOX1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox1Q9D350 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms