Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms