Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms