Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms