Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc47Q9D024 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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