Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CYI0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CYI0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CYI0 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CYI0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CYI0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9CYI0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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