Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mis12Q9CY25 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms