Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Sgo1Q9CXH7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Sgo1Q9CXH7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Sgo1Q9CXH7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Sgo1Q9CXH7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Sgo1Q9CXH7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Sgo1Q9CXH7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Sgo1Q9CXH7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Sgo1Q9CXH7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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