Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Rpusd4Q9CWX4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rpusd4Q9CWX4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rpusd4Q9CWX4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rpusd4Q9CWX4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rpusd4Q9CWX4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rpusd4Q9CWX4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rpusd4Q9CWX4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rpusd4Q9CWX4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rpusd4Q9CWX4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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